盆地狀的千年古都被比叡山、東山、嵐山三面環抱，鴨川與桂川在二條城外匯成dna雙螺旋狀的水網。棋盤式街道暗合長安城108坊布局，每處十字路口地下十米都埋著武周時期的青銅渾天儀——這是則天會布設的克隆基地坐標節點。

東山苔寺青苔在月光下泛著生物電流的幽藍，每片苔蘚都是活體傳感器。當美咲的胎記靠近時，苔庭會浮現出楊貴妃手書的《霓裳羽衣曲》基因譜。

哲學之道兩公里櫻樹隧道實為時空褶皺，樹干內嵌著液態水晶導管。飄落的花瓣帶有磁懸浮屬性，會在子夜排列成遣唐使星圖。

嵐山竹海三十萬根孟宗竹構成天然法拉第籠，竹節里生長著初代克隆體培育艙。竹葉摩擦聲實為摩斯電碼，重復發送"玉環永生"的警告。

只園町屋看似傳統的木格子窗欞實為碳納米管編織，障子紙能顯示全息能劇。地窖里藏著昭和時期改造的低溫克隆艙，制冷劑是提煉自貴妃香囊的龍腦晶。

京都塔量子站1964年建造的針狀塔實為時空錨點，玻璃幕墻在暴雨夜會投射出平安京全息影像。地下200米藏著與驪山地宮相連的蟲洞發生器。

伏見稻荷千本鳥居上萬座朱紅牌坊構成生物電路板，當林深的北斗七星痣觸碰到特定鳥居時，會打開通往公元759年難波津的量子隧道。

黃昏時東山涌起的藍紫色暮靄，實則是克隆體排放的端粒酶廢氣。

町屋紙燈籠內置生物熒光，光源來自基因改造過的螢火蟲卵巢。

鴨川水面漂浮著武周時期的青銅鏡殘片，折射出多重時空疊影。

清水寺鐘聲混著納米蟲振翅的20hz次聲波。

先斗町木屐聲被青石板下的壓力傳感器轉化為基因測序指令。

鞍馬山瀑布隱藏著水錘泵機房，轟鳴聲與楊貴妃克隆體的心跳同頻。

銀閣寺墻泥摻著玄宗年間龍涎香凍干粉，遇雨水蒸騰出致幻劑。

錦市場昆布攤下埋著揮發永生酶的黑市反應釜。

下鴨神社糺之森彌漫的腐殖質氣息，實為克隆體代謝的端粒碎片。

在每月朔日（新月）的丑時三刻：

四條大橋石柱浮現出甲骨文刻的克隆體編號。

二條城唐門自動解體重組為武周時期通天宮闕。

鴨川逆流形成克萊因瓶狀水環，溺死者會從平安京時代的加茂川浮出。