由于信息傳遞以及交通的極度不便利，決定返航之后，單是從荷蘭、法國、英國、葡萄牙、普魯士、威尼斯等諸多國家收攏人員便花去了數月時間，在一切準備就緒之后，船隊從里斯本拔錨起航，踏上了回國的漫長航程。

在這接近五年的時間中，使團成員以及那些孩童、護衛、仆從等等，因為各種各樣的原因，已經先后有數十人歿于異國他鄉，這其中水土不服導致的急癥突發是最主要原因。

現在的歐洲并沒有誕生后世的那種西醫醫術，在沒有抗生素的時代，急癥突發就只能聽天由命。

中醫藥對于慢性疾病的治療是比較有效的，可面對急癥也是束手無策。

隨隊的太醫院太醫胡方文雖然醫術高超，但也只能眼睜睜看著發病之人在自己眼前慢慢離世，作為一名懸壺濟世的醫者，胡方文等人面對如此場景，內心的痛苦和自責旁人無從知曉。

罹難人員的尸骨就地火化后被裝入陶罐帶回大明，后續的撫恤事宜自有朝廷處置。

有了來時的經驗，船隊返航途中經過好望角時特意往西繞了個大圈子，避開了常年風暴肆虐的危險區域，雖說又多耗費了月余的時間，但安全性卻有了更充分地保障。

“我適才問過胡太醫了，他說，在用藥施針之后，笛先生現下已無大礙，不過最好在陸地上休養一段時日，不然的話會留下后患，對其壽命會十分不利。

密之，適才船長說了，前行不遠就是馬尼拉，咱們可否在馬尼拉港停駐一段時間，讓笛先生歇息數日？

長時間呆在海上，常人的確是難以招架得住，更何況是病患。

雖說與其他船只無法交通，但我琢磨著，病疾者應不在少數，這眼看就快到家了，死于半道之上，實在是太過可惜！”

鄭芝鳳把胡方文的話轉述一遍后建議道。

“也好！

抵達馬尼拉港之后，各船發病之人先行上岸尋地休養，其他人等輪番上岸修整，親軍護衛要時刻保持警覺，以防西班牙人做出不利之舉動！

一旦事有不諧，船隊立刻起航！

再就是，鳴山還要暫且忍耐，畢竟我等身負使命，小不忍則失大謀，一切待回國后再說！”

方以智稍微思忖之后做出了決定，但在最后還是特意囑咐了鄭芝鳳幾句。

由于時間差和信息交流異常不順的緣故，方以智他們并不知道，現在的馬尼拉港已經易手。

他們只是從荷蘭政府那里獲悉，大明很可能對呂宋的西班牙人采取軍事行動，而西班牙政府正在討論派發大兵遠征大明。

因為西班牙使團在大明自取其辱的原因，兩國之間的關系已經降到了冰點，雙方之間的戰爭似乎已經無法避免。

在前往歐洲的途中，船隊曾在馬尼拉靠泊，以便補充淡水和食物，當時西班牙人對他們的態度就十分傲慢和惡劣，索要的補給費用也是遠高于其他船只，這還是在鄭芝鳳報出名號后的結果。

鄭芝鳳當時一氣之下便要乘船返航，準備回福建帶著鄭家船隊過來教訓一下這群紅夷，在方以智的竭力阻止下這才忍了下來，但從此他對西班牙人便惡感陡生，揚等將來回返后，定要教西班牙人好看。