趙文華將浙直兩省的精銳要回來后，當即就交給了胡宗憲和唐順之，趙文華很清楚，自己又不會打仗，唐順之、胡宗憲都是知兵之人，肯定比他趙文華的水平高，放手給他們指揮，趙文華這點自知之明還是有的，還有個考慮就是到時候方便推卸責任。

趙文華在安排兵力的時候，張經也在調集兵力，準備與倭寇大戰一場，雖然現在張經不再是總督了，但是他還是南京兵部尚書參贊機務，可以調動南京的部分駐軍。張經將操江提督下的水師悉數調來，駐泊于蘇松和嘉興附近的港口。

作為新任浙直總督，趙文華在上任后的第一件事就是籌措軍費，和張經準備與倭寇大戰不同，趙文華的主張是先修繕各處的城墻，防止倭寇襲擾大明的州縣，減少倭寇帶來的損失，所以趙文華決定在浙直沿海的州縣修葺城墻，加強防備。

趙文華已經和唐順之、胡宗憲等人商量好了，軍費和修筑城墻的一共是一百三十萬兩，其中浙江軍費四十七萬兩，江南五十萬兩，江北一十七萬兩，地方州縣和總督各分攤一半，趙文華已經算過了，浙直等處可以加派提編一共是四十三萬兩，，還缺少二十萬兩。

這二十萬兩，其中十萬兩由兩淮食鹽工本銀中撥出，另外十萬兩，趙文華也已經有的著落，就是南京兵部積貯船料銀，這筆銀子差不多有十萬兩，足夠前線軍需。

不過趙文華知道，現在是張經當這個南京兵部尚書，想從張經手里要這十萬兩肯定是不現實的，唯一的辦法就是通過京師，趙文華只得向朝廷上疏索要這筆銀子。

趙文華給朝廷上了一道奏疏名為請撥南京兵部結余以紓民困疏的奏疏。

趙文華奏稱：自倭寇軍興以來，江南應天、蘇松等處，加派兵餉銀四十三萬五千九百余兩。國家財用耗于御虜，庫藏空虗，措置實難，茍非暫為權宜之術，則無以救燃眉之急。臣等愚見，欲將各省并直隸府分未曾被兵去處，或取自官庫，或暫借歲派，各分定錢糧數目，

及應接濟地方，立限解送，以供軍儲。其各處所調人馬行糧，徑令本省動支倉庫錢糧，照數給付。若各處解銀未到，糧餉一時無措，許令各該撫按官榜示富室，諭以禍福利害，各令量出資財以助軍需。

而今加派提編，數目頗大，軍需芻粟，無別項可挪之財，近日不過有司便宜，量取民間。義勇水兵之差，城夫船夫之擾，軍餉衣甲器械之費，無家不到，無室不空。

臣愚以為軍需必不可缺，而民困尤所當紓。今又上海筑城，松江修城，估用銀二十八萬兩，議欲半出民間，此后騷擾未有期也。況今歲田稻，上海無望，華亭半為役占，秋來會計起運之數，又不知在何處取盈也。

而今所缺者二十萬兩，半自兩淮工本銀中取，其余十萬兩，則議取南京兵部積貯船料銀，以供軍需。

今東南水陸兵糧，往往有缺至三四月不給者，軍士萬里捐生，日望升數之米而已，而又不時給之，心生讟語，亦何足怪此有故矣。