第二天，袁崇煥用上好的楠木棺材收斂了毛文龍的尸體。并且當著萬余將士的面，宣布了昨天的事情。袁崇煥久在遼東，積威甚重，將士們都敬畏他。特別是現在是雙島，在袁崇煥的地盤內，所以斬殺毛文龍并未引起太大的波動。

袁崇煥將楠木棺材擺在大校場的正**，搭建了簡易的靈堂，朝著萬余將士和毛文龍的余部飽含深情的說道：“毛帥，老哥，小弟昨天殺你，是不能不顧朝廷的法律，你我皆為朝廷命官，做官第一要務就是遵紀守法，如果連我們都不能帶頭表率，怎能指望將士們軍紀嚴明呢？但我今天要祭奠你，對于我來說除掉你總兵的身份，你是我的兄長，也是我的朋友，我在這里給你準備了上好的京師女兒紅，請你暢飲！”

說罷，將手中的酒瓶打開，將酒倒在棺木周圍，然后扶棺大慟，頗有些諸葛亮哭周瑜的味道，情之深意之切，在場的萬余將士無不落淚，毛文龍的部將更是哭的上氣不接下氣，這些人一是在哭毛文龍，二是在哭自己，畢竟毛文龍一死，皮島群龍無首，自己以后何去何從呢，眾人前途未卜，眼淚倒是真的，一時間萬余將士哭聲震天。

緊接著，袁崇煥安排毛文龍余部乘船，自己也領精兵三千和福建水師艦隊一起返回皮島，手持尚方寶劍當中宣讀了對皮島眾人的處置，皮島留守的毛承祚，陳繼盛等人得知大帥身死的消息之后大吃一驚，但是袁崇煥三千精兵很快控制住了局面，毛承祚就是有心造反，也不敢輕舉妄動，隨即袁崇煥恩威并施，好好的展示了一番督師的手段，赦免了皮島眾人的罪過，并且將他們官升一級，保舉毛文龍的兒子繼任東江副總兵的位子。毛承祚猛然升到副總兵高位，雖然老爹被袁崇煥斬了，但是心下喜不自勝。

袁崇煥將毛文龍在皮島的兩萬兵馬分成四協，將毛承祚，陳繼盛，徐敷奏，劉光祚分別作為每一協的首領，毛文龍本身有天啟皇帝御賜的尚方寶劍和敕印，也被袁崇煥收回，然后交給毛承祚和陳繼盛保管，又將島上的軍民全部聚集到一起，宣讀了廢除毛文龍苛政和實施朝廷新政的政策，并且將隨船帶來的十萬兩白銀分發給島上的居民，這一舉動也贏得了民心。暫時是將島上的局勢完全穩定住了，可是也留下了巨大的隱患，從此以后，皮島軍民不再是一塊鐵板，而是分成了四塊，互相不統屬，陳繼盛和毛承祚同為副總兵，也為日后誰也不服誰，誰也不聽誰的事情埋下了隱患。

回到了錦州，袁崇煥立刻將此事寫成奏折，飛馬直報京師，崇禎皇帝接到奏折之后大為光火，將韓爌招到養心殿，王承恩將袁崇煥的奏折遞到韓爌手上，韓爌一目十行的掃視一遍。崇禎怒道：“袁崇煥這個混賬，朕賜給他尚方寶劍，臨行之前千叮嚀萬囑咐，讓他就算是對毛文龍不滿，也要將其抓捕押解京師，由朕組織三司問罪，他可倒好，直接把毛文龍斬了，毛文龍是一品左都督，說起來官不比袁崇煥小，他這么擅自作為，將朕置于何地，如果逼得毛文龍舊部造反，這個責任他擔待的起嗎？遼事如果因此敗壞，朕就剮了袁崇煥。”

韓爌看完了奏折心想，這個袁崇煥行事太過放肆，竟然擅自做主斬殺一品大員，當今圣上生性多疑，你這么大張旗鼓的干，有將遼東二十萬大軍變成袁家軍的可能，這是皇上絕對不能容忍的，但袁崇煥確實是個將才，從寧遠大捷和東南大捷可以看出此人領兵卓有成效，在此多事之秋，還是不動他為好。

韓爌此人剛正不阿，對事不對人，他不管是誰在遼東總督的位置上，只要此人能抵抗建虜，那就不能輕易撤換，楊鎬就是前車之鑒，大明薩爾滸一戰精銳盡喪，十年了都還沒有緩過來，軍報說袁崇煥好不容易練出了一支關寧鐵騎，可不能讓這只精銳部隊再折了。

想到此韓爌立刻勸崇禎道：“圣上，自古兵法有云，將在外君命有所不受，既然皇上信任袁崇煥，那現在就不能動他，他既然已經上書五年平遼，那姑且信他，如果真有問題再斬他不遲，而且據臣了解，袁崇煥督師遼東已有成效，麾下兩萬精騎已經可以和八旗軍抗衡，現在撤換他，群龍無首，恐怕會出亂子，為今之計應當安撫袁崇煥并且圣上要絕對支持他，以安軍心民心，另外毛文龍雖然有功于社稷，可是不法之事臣也有所耳聞，即便是三司會審，恐怕其罪也是當斬，既然毛文龍已死，折子上又說他的兒子和部下已經被安撫，那么就只有委屈下毛文龍將此事扛下來了，臣建議，立刻褒獎袁崇煥，但只賞金銀綢緞不封官職，我想袁崇煥應該明白圣上的意思，另外皇上立刻擬旨宣布將毛文龍的罪行昭告天下，毛文龍本就和閹黨魏忠賢過從甚密，竟然在皮島上還給魏忠賢修建生祠，京師里也有他的東江聯絡點，臣以為應立刻發兵鏟除聯絡點，施放明確信號給天下人。”